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Gustave Roussy
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GUSTAVE ROUSSY
1er centre de lutte contre le cancer en Europe, 3 000 professionnels mobilisés

Offres d'emploi


Dans le cadre d'une politique volontariste en faveur des personnes en situation de handicap, toutes les candidatures reçues sont étudiées à compétences égales.

Chargé.e de parcours génomique

Personnes à contacter :

Pr Michel Vidaud, Directeur médical du laboratoire : michel.vidaud@laboratoire-seqoia.fr
Florence Baguet, Directrice opérationnelle du GCS SeqOIA : florence.baguet@laboratoire-seqoia.fr

 

Le ou la candidat(e) sera employé en CDI par l’un des établissements du GCS pour être mis(e) à disposition auprès du GCS SeqOIA. Les candidats titulaires de la fonction publique hospitalière peuvent être mis à disposition auprès du GCS SeqOIA par l’APHP (après mutation à l’APHP si nécessaire).
Poste disponible à compter de l’été 2022.

 

Présentation de la structure

Le projet SeqOIA (Sequencing, Omics, Information Analysis) est l’une des deux plateformes sélectionnée par le Ministère des Solidarités et de la Santé dans le cadre de l’appel à projet pour la mise en oeuvre de plateformes de séquençage très haut débit à visée sanitaire du Plan France Médecine Génomique 20251. Elle est adossée à un Groupement de Coopération Sanitaire (GCS SeqOIA) de droit privé associant l’AP-HP, l’Institut Curie et Gustave Roussy, en lien avec la société industrielle Integragen.

 

Le laboratoire de biologie médicale SeqOIA2 est constitué :

  • d’une plateforme d’analyse SeqOIA-GEN localisée dans le bâtiment Leriche (ancien hôpital Broussais) en charge de la réception des échantillons, de l’extraction des acides nucléiques et de la production des données de séquençage ;
  • d’une plateforme de Bio-informatique SeqOIA-IT localisée au sein du campus Picpus de l’AP-HP, agréée à l’hébergement des données et en charge du traitement bio-informatique des données ;
  • d’une plateforme d’interprétation composée de biologistes experts des laboratoires de médecine génomique : 1 Institut Curie, 1 Gustave Roussy et 6 AP-HP (1 par université hébergeant une faculté de Médecine). Ces biologistes exercent dans leurs établissements respectifs.

La plateforme a pour objectif de produire à terme 18 000 équivalents génomes en 2022 soit l’équivalent de 6 000 dossiers. Afin de garantir un accès équitable des patients sur tout le territoire, elle prendra en charge les patients des régions Ile-de-France, Bretagne, Pays de la Loire, Normandie, Hauts de France, Centre Val de Loire. Elle est actuellement dans une phase de montée en charge de son activité : 14 000 échantillons ont été séquencés entre 2019 et fin décembre 2021.

Le poste concerne l’équipe de SeqOIA-GEN. Il est localisé sur le site de l’ancien hôpital Broussais, bâtiment Leriche à l’endroit où sont assurés l’accueil des échantillons, leurs préparations et le séquençage.
Des équipements de dernière génération ont été installés sur la plateforme, en particulier quatre séquenceurs NovaSeq 6000®. Le laboratoire dispose de logiciels dédiés développés uniquement pour son activité : e-prescription, système de gestion de l’information de laboratoire et logiciel d’interprétation.

 

Trois types d’analyses sont réalisés sur la plateforme : génome complet (WGS), exome complet (WES) et transcriptome (RNASeq) dans le domaine des maladies rares, du cancer puis des maladies communes. Des discussions avec le Plan France Médecine Génomique 2025 sont en cours afin d’augmenter le nombre d’analyses réalisées.

 

L’équipe située sur Broussais est composée de 3 technicien.ne.s de laboratoire (un 4ème recrutement est en cours), d’une équipe qualité composée de 2 personnes, d’un biologiste-responsable, d’une responsable administrative et d’une assistante de prescription. Sept personnes de l’équipe d’une société chargée du séquençage travaillent également au sein du laboratoire.

 

Identification du poste

Établissement

GCS SeqOIA
Site Broussais - Bâtiment Leriche – RDC Bas
Rue Huguette Schwartz, 75014 PARIS

 

Définition générale du poste

L’assistant.e de prescription facilite la prescription des analyses de séquençage de haut débit et assiste les cliniciens prescripteurs et l’équipe du laboratoire pour résoudre les non-conformités de prescription.
Il ou elle participe à la réception des échantillons et au contrôle de la conformité des dossiers en amont de la préparation des acides nucléiques et du séquençage, et assure des missions de coordination auprès des intervenants concernés pour lever ces non-conformités, dans le cadre de la politique qualité du laboratoire.

 

Activités :

  •  Aide à la création des comptes prescripteurs dans le logiciel de e-prescription SPICE
  •  Aide au remplissage des dossiers de prescription en lien avec les équipes des établissements.
  •  Identification des non-conformités dans les dossiers et retour vers les équipes de soin et prescripteurs concernés pour les lever
  •  Assistance à la mise en place du circuit des prélèvements jusqu’au lieu d’enlèvement par le transporteur dédié
  •  Contrôle de la réception des échantillons avec le transporteur dédié
  •  Formation et information des équipes cliniques aux bonnes pratiques de prescription : par téléphone, courriel ou via la page dédiée prescripteurs du site web
  •  Mise en place d’indicateurs de qualité pour suivre les bonnes pratiques de prescription
  •  Mise à jour des RCP dans les outils informatiques du laboratoire
  •  Vérification de la concordance des rôles entre les acteurs de la chaîne de prescription
  •  Constitution des comptes-rendus techniques
  •  Participation active à la politique qualité instaurée par le LBM (ISO 15189)
  •  Utilisation du logiciel qualité (Kalilab®)
  •  Assure la traçabilité de ses activités
  •  Participation à la déclaration et au traitement des non-conformités
  •  Rédactions de la documentation inhérente à son activité
  •  Participe à la vie du laboratoire

Positionnement du poste et compétences requises

Liens hiérarchiques

  •  Le directeur médical du LBM SeqOIA
  •  La directrice opérationnelle de la plateforme

Liens fonctionnels

  •  Les prescripteurs et les biologistes
  •  Les technicien.ne.s de laboratoire
  •  Le responsable assurance qualité et son adjointe

Connaissances associées

  •  Connaissance approfondie des lois de bioéthique et de la règlementation en matière d’analyses génétiques
  •  Connaissance du fonctionnement et de la réglementation d’un laboratoire de biologie médicale
  •  Connaissance de la règlementation RGPD et des règles de confidentialité médicale
  •  Connaissances informatiques de base
  •  Connaissances des règles d’hygiène et de sécurité au travail

Qualités requises

  •  Capacité à communiquer et s’adapter au travail en équipe
  •  Sens de l’organisation et rigueur méthodologique
  •  Sens des responsabilités et esprit d’initiative
  •  Précision, rigueur dans l’organisation et l’exécution du travail
  •  Capacité à discuter avec différents professionnels : cliniciens, biologistes, bio-informaticiens…
  •  Capacités à suivre des instructions de travail
  •  Conscience professionnelle
  •  Disponibilité, autonomie
  •  Respect du secret professionnel
  •  Respect des règles de qualité et de sécurité (Norme ISO15189, risques professionnels etc.)
  •  Capable de faire un retour synthétique du travail effectué et des difficultés rencontrées
  •  Capacité à prendre des initiatives

Conditions de travail

  • Poste à 100%.
  • Plages horaires du laboratoire : lundi au vendredi de 8H à 18H30.
  • Les horaires de présence sont fixes, en 7h par jour, à organiser entre 8h et 17H30 avec une pause déjeuner de 1h.
  • La rémunération proposée tiendra compte de l’ancienneté du/de la candidat.e et de son statut (fonctionnaire hospitalier ou contrat de droit privé).
Contact: 

GCS SeqOIA
Site Broussais - Bâtiment Leriche – RDC Bas
Rue Huguette Schwartz, 75014 PARIS