Personnes à contacter :

Pierre Blanc, Biologiste-responsable du laboratoire : pierre.blanc@aphp.fr
Florence Baguet, Directrice opérationnelle du GCS SeqOIA : florence.baguet@aphp.fr
Emploi en CDI par l’un des établissements du GCS pour être mis à disposition du laboratoire SeqOIA
Poste disponible à compter d’avril 2023.

PRESENTATION DE LA STRUCTURE

Le laboratoire SeqOIA (Sequencing, Omics, Information Analysis) est l’un des deux laboratoires sélectionné par le Ministère des Solidarités et de la Santé dans le cadre de l’appel à projet pour la mise en oeuvre de plateformes de séquençage très haut débit à visée sanitaire du Plan France Médecine Génomique 2025. Il est adossé à un Groupement de Coopération Sanitaire (GCS SeqOIA) de droit privé associant l’AP-HP, l’Institut Curie et Gustave Roussy.

Le laboratoire de biologie médicale SeqOIA est constitué de deux sites:

• SeqOIA-GEN (Site Broussais, batiment Ady Steg, 8 rue Maria Helena Da Silva 75014 :
  Gestion pré-analytique : logistique, réception et enregistrements des prélèvements
  Phase analytique ‘humide’ : depuis l’extraction des acides nucléiques jusqu’au séquençage
• SeqOIA-IT (Site Picpus, 33 bd Picpus 75012) : traitement bioinformatique des données

Plus de 200 biologistes sont habilités à la validation des examens SeqOIA pour l’ensemble des pré-indications FMG2025. Ils sont répartis dans l’ensemble des établissements de santé du territoire SeqOIA et valident à distance.
Le laboratoire SeqOIA a pour mission sanitaire de garantir un accès équitable aux examens de séquençage pangénomiques sur l’ensemble du territoire qui lui est dévolu (régions Ile-de-France, Bretagne, Pays de la Loire, Normandie, Hauts de France, Centre Val de Loire).

Le poste concerne l’équipe de SeqOIA-GEN, au laboratoire. Il est localisé principalement sur le site Broussais (SeqOIA-GEN). Il est toutefois en lien régulier avec l’équipe informatique et bioinformatique (SeqOIA-IT)
Le laboratoire dispose de logiciels dédiés développés et maintenus uniquement pour son activité : e-prescription, système de gestion de l’information de laboratoire et logiciel d’interprétation des examens.

Les examens proposés par le laboratoire sont les suivants :

• Maladies rares et oncogénétique: génome constitutionnel
• Cancers : exome tumoral, génome constitutionnel, génome tumoral et transcriptome tumoral

L’équipe technique du site Broussais est composée de 5 biologistes , 1 ingénieur technique de 9 techniciens de laboratoire, un opérateur technique, 2 responsables qualité, une responsable administrative et une chargée de parcours génomique.

IDENTIFICATION DU POSTE

ÉTABLISSEMENT
Laboratoire SeqOIA (support jurique : GCS SeqOIA)
Site Broussais - Bâtiment Leriche – RDC Bas
Rue Huguette Schwartz, 75014 PARIS

DÉFINITION GÉNÉRALE DU POSTE
Le concepteur & développeur BI a pour mission la conception et le développement d’outils de monitorage et de pilotage du Laboratoire SeqOIA : exploitation des indicateurs, développement de tableaux de bord et de solutions de visualisation des données.

Ses missions sont réalisées en liaison avec le biologiste-responsable du laboratoire, le responsable SI & bioinformatique du laboratoire, ainsi que la directrice opérationnelle du GCS.

ACTIVITÉS :

• Recueillir les besoins et exploiter les indicateurs (analyses de tendances et statistiques)
• Concevoir, développer et maintenir les tableaux de bord
• Assurer la qualité de la donnée et des solutions de visualisation
• Assurer la documentation des tableaux de bord et indicateurs

POSITIONNEMENT DU POSTE ET COMPETENCES REQUISES

LIENS HIÉRARCHIQUES

• Le biologiste-responsable du laboratoire SeqOIA
• La directrice opérationnelle de la plateforme

LIENS FONCTIONNELS

• Les personnels de l’équipe SeqOIA-IT
• Les biologistes du laboratoire
• La responsable assurance qualité et son adjointe

CONNAISSANCES ASSOCIÉES

• Maitrise des outils de Business Intelligence
• Maitrise des bases de données (MongoDB , SQL)
• Maitrise d’un langage de programmation (Python, R)
• Maitrise des méthodes et concepts de Business Intelligence
• Capacité d’analyser et formaliser les besoins utilisateurs
• Connaissance de la règlementation informatique et liberté
• Animer, communiquer et motiver au sein d’une équipe projet

 
QUALITÉS REQUISES

• Capacité à communiquer et s’adapter au travail en équipe
• Sens de l’organisation et rigueur méthodologique
• Sens des responsabilités et esprit d’initiative
• Précision, rigueur dans l’organisation et l’exécution du travail
• Capacité à discuter avec différents professionnels : cliniciens, biologistes, bio-informaticiens etc.
• Capacités à suivre des instructions de travail
• Conscience professionnelle
• Disponibilité, autonomie
• Respect du secret professionnel
• Capable de faire un retour synthétique du travail effectué et des difficultés rencontrées
• Capacité à prendre des initiatives

CONDITIONS DE TRAVAIL

• Poste à 100%.
• Plages horaires du laboratoire : lundi au vendredi de 8H à 18H30.
• Possibilité de télétravail partiel
• La rémunération proposée tiendra compte de l’ancienneté.