Informations pratiques
Adresse

Gustave Roussy
114, rue Édouard-Vaillant
94805 Villejuif Cedex - France

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Tel : +33 (0)1 42 11 42 11

Urgences

Gustave Roussy n'assure que les urgences des patients pris en charge à l'Institut.
Urgences uniquement : +33 (0)1 42 11 50 00

GUSTAVE ROUSSY
1er centre de lutte contre le cancer en Europe, 3 000 professionnels mobilisés

Offres d'emploi


Dans le cadre d'une politique volontariste en faveur des personnes en situation de handicap, toutes les candidatures reçues sont étudiées à compétences égales.

Data manager - CDI de chantier

Description du poste

Gustave Roussy, Premier Centre de Lutte Européen contre le Cancer recrute : Un(e) data manager (H/F) pour participer au développement de la médecine de précision en oncologie pédiatrique.
Le ou la candidat(e) aura pour mission de structurer les données générées par les projets de séquençage accompagnant plusieurs essais et projets en oncologie pédiatrique. Il/elle s’appuiera sur un entrepôt de données cliniques et génomiques, existant, pour fluidifier le stockage et le référencement des données brutes ainsi que leur post-traitement. En parallèle, le ou la candidat(e) aura pour mission, dans le cadre du projet « BoOST-DataS » financé par l’Institut National du cancer (INCa ; project PARPEDIA2019-0), de mettre en place une base de données clinique, biologique, génomique et radiomique sur l’ostéosarcome, du diagnostic à la rechute.
Le ou la candidat(e) interagira avec des bioinformaticiens, des biologistes et des cliniciens travaillant sur des thématiques de recherche fondamentale, translationnelle et pré-cliniques, donc dans un environnement pluridisciplinaire où écoute et force de proposition sont des atouts essentiels à l’aboutissement des projets.

 

Missions

  • Coordonner l’échange des données Omics entre les centres et équipes participants aux essais et projets ancillaires en oncologie pédiatrique,
  • Collecter, curer et labéliser les données Omics réceptionner afin de les verser dans des entrepôts de données,
  • S’assurer des bonnes pratiques concernant le transfert, le traitement et l’anonymisation des données,
  • Alimenter et déployer des bases de données et portails de données,
  • Développer des applications middleware pour connecter ces bases et portails de données.

Formation

  • Titulaire d‘un master2 dans le domaine de la Bioinformatique/Informatique avec de l’expérience en gestion et traitement des données et une appétence pour le développement informatique/bioinformatique.

Compétences techniques :

  • Programmation : Shell, Python/Java/JavaScript, Base de données SQL, GitHub, Docker,
  • Bioinformatique : Des connaissances préalable sur les analyses génomiques et transcriptomiques seront appréciées (BWA, GATK, Salmon, DESeq2,…).

Aptitudes :

  • Adaptabilité,
  • Capacité à interagir et à travailler en équipe,
  • Rigueur, méthode et dynamisme.

Type de contrat

  • 4 ans en CDI de chantier avec possibilité d’évolution au sein de Gustave Roussy, à pourvoir dès que possible, rémunération à ajuster selon expérience.
  • Compétences techniques :
  • Programmation : Shell, Python/Java/JavaScript, Base de données SQL, GitHub, Docker,
  • Bioinformatique : Des connaissances préalable sur les analyses génomiques et transcriptomiques seront appréciées (BWA, GATK, Salmon, DESeq2,…).

Dans le cadre de notre politique volontariste en faveur de l’insertion des personnes en situation de handicap, toutes les candidatures reçues sont étudiées à compétences égales.

 

Merci d’adresser lettre de motivation en précisant vos prétentions salariales et CV sous la référence AE-03-2020 CDIC DATAMANAGER à :
Mme Karthiga KANAGASABAI - rhrecherche2@gustaveroussy.fr
Chargée de recrutement
Bâtiment de Médecine Moléculaire
114 rue Edouard Vaillant
94800 Villejuif

 

Contact: 

Gustave Roussy,
Mme Karthiga KANAGASABAI
Chargée de recrutement
Bâtiment de Médecine Moléculaire
114 rue Edouard Vaillant
94800 Villejuif