Equipement de la Plateforme d'Imagerie et Cytométrie
Le parc d'instruments disponibles sur la PFCI comprend :
- 1 cytomètre de Masse Helios (Fluidigm)
- 1 Imageur par cytométrie de masse Hyperion (Fluidigm)
- 1 Cytomètre spectral Aurora (Cytek)
- 2 cytomètres en flux ; Fortessa (BD Biosciences) et Cytoflex (Beckman Coulter)
- 3 trieurs de cellules ; 2 Fusion et 2 Influx tous équipés UV (BD Biosciences)
- 1 microscope Multiphoton ; SP8 (Leica)
- 3 microscopes confocaux ; SPE et SP8 (Leica) et FV10i (Olympus )
- 2 Microscopes spinning disk (Gataca Systems) dont 1 Super résolution sur base Nikon
- 1 macroscope de fluorescence ; AZ100 (Nikon)
- 1 imageur petit animal bioluminescence /fluorescence ; IVIS 50 (PerkinElmer)
- 1 imageur petit animal bioluminescence /fluorescence –scanner 3D : IVIS Spectrum (PerkinElmer)
- 1 scanner de lames ; Provis 50 (Olympus) + cartographie (Microvision)
- 1 endomicroscope de fluorescence ; Cellvizio (Maunakea)
- 1 vidéomicroscope ; Fluorescence DMI8 (Leica)
Soit un parc instrumental de 20 appareils, dont 70% de dernière génération dans 250 m2 de locaux dédiés.
Traitement des données
Pour le traitement des données, la plate-forme met à disposition :
- 1 serveur / calculateur Hive (Acquifer)
- 4 stations de traitement déportées disponibles en libre-service, pour le traitement off-line des images.
Les logiciels : IMARIS, VOLOCITY, ImageJ, Fiji, ICy, METAMORPH, et ARIVIS et offrent une large possibilité de traitements 2D à 5D, et de quantification en batch des images. Egalement disponible sur ces stations, le logiciel LIVING IMAGES spécialement adapté à la quantification bioluminescence et fluorescence des données issues des imageurs petit animal. - 2 stations de traitement des données de cytométrie comprenant les logiciels : Diva, FlowJo, Kaluza, et Spade
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