Imagerie et cytométrie

Equipement de la Plateforme d'Imagerie et Cytométrie

Le parc d'instruments disponibles sur la PFCI comprend :

• 1 cytomètre de Masse Helios (Fluidigm)
• 3 cytomètres en flux ; C6 Accury et LSR II  (BD Biosciences) et Cyflow space (Sysmex)- LSR –Fortessa (BD Biosciences)  
• 4 trieurs de cellules ; Fusion UV, ARIA III et 2  Influx dont 1  équipé UV (BD Biosciences)
• 1 microscope Multiphoton ; SP8 (Leica)
• 3 microscopes confocaux ; SPE et SP8 (Leica) et FV10i (Olympus )
• 2 Microscopes spinning disk (Gataca Systems) dont 1 Super résolution sur base Nikon
• 1 macroscope de fluorescence ; AZ100 (Nikon)
• 1 imageur petit animal bioluminescence /fluorescence ; IVIS 50 (PerkinElmer)
• 1 imageur  petit animal bioluminescence /fluorescence –scanner 3D : IVIS Spectrum (PerkinElmer)
• 1 scanner de lames ; Provis 50 (Olympus) + cartographie (Microvision)
• 1 endomicroscope de fluorescence ; Cellvizio (Maunakea)
• 2 vidéomicroscopes ;  Fluorescence DMI8 (Leica) et Fond clair DM 2500 (Leica)

Soit un parc instrumental de 20 appareils, dont 70% de dernière génération dans 280 m2 de locaux dédiés.

Traitement des données

Pour le traitement des données, la plate-forme met à disposition :

• 4 stations de traitement déportées disponibles en libre-service, pour le traitement off-line des images.
  Les logiciels : IMARIS, VOLOCITY, ImageJ, Fidji, ICy, METAMORPH, et ARIVIS et offrent une large possibilité de traitements 2D à 5D, et de quantification en batch des images. Egalement disponible sur ces stations, le logiciel LIVING IMAGES spécialement adapté à la quantification bioluminescence et fluorescence des données issues des imageurs petit animal.
• 2 stations de traitement des données de cytométrie comprenant les logiciels : Diva, FlowJo,  Kaluza, et Spade