Informations pratiques
Adresse

Gustave Roussy
114, rue Édouard-Vaillant
94805 Villejuif Cedex - France

Standard

Tel : +33 (0)1 42 11 42 11

Urgences

Gustave Roussy n'assure que les urgences des patients pris en charge à l'Institut.
Urgences uniquement : +33 (0)1 42 11 50 00

GUSTAVE ROUSSY
1er centre de lutte contre le cancer en Europe, 3 000 professionnels mobilisés

Offres d'emploi


Dans le cadre d'une politique volontariste en faveur des personnes en situation de handicap, toutes les candidatures reçues sont étudiées à compétences égales.

Technicien de Laboratoire de Biologie Médicale - Groupement SeqOIA

Le ou la candidat(e) sera employé en CDI par l’un des établissements du GCS pourêtremis(e)à disposition auprès du GCS SeqOIA. Les candidats titulaires de la fonction publique hospitalière peuvent être mis à disposition auprès du GCS SeqOIA par l’APHP(après mutation à l’APHP si nécessaire).

 

Présentation de la structure

Le projet SeqOIA (Sequencing, Omics, Information Analysis) est l’une des deux plateformes sélectionnée par le Ministère des Solidarités et de la Santé dans le cadre de l’appel à projet pour la mise en oeuvre de plateformes de séquençage très haut débit à visée sanitaire du Plan France Médecine Génomique 2025. Elle est adossée à un Groupement de Coopération Sanitaire (GCS SeqOIA) de droit privé associant l’AP-HP, l’Institut Curie et Gustave Roussy, en lien avec la société industriel Integragen.

 


Le laboratoire de biologie médicale SeqOIA2 est constitué :

  • d’une plateforme d’analyse SeqOIA-GEN localisée dans le bâtiment Leriche (ancien hôpital Broussais) en charge de la réception des échantillons, de l’extraction des acides nucléiques et de la production des données de séquençage ;
  • d’une plateforme de Bio-informatique SeqOIA-IT localisée au sein du campus Picpus de l’AP-HP, agréée à l’hébergement des données et en charge du traitement bio-informatique des données ;
  • d’une plateforme d’interprétation composée de biologistes experts des laboratoires de médecine génomique : 1 Institut Curie, 1 Gustave Roussy et 6 AP-HP (1 par université hébergeant une faculté de Médecine). Ces biologistes exercent dans leurs établissements respectifs.

La plateforme a pour objectif de produire à terme 18 000 équivalents génomes en 2022. Afin de garantir un accès équitable des patients sur tout le territoire, elle prendra en charge les patients des régions Ile-de-France, Bretagne, Pays de la Loire, Normandie, Hauts de France, Centre Val de Loire. Elle est actuellement dans une phase de montée en charge de son activité : 6 000 échantillons ont été séquencés en mai 2021. L’ouverture récente de nombreuses pré-indications contribue à cette augmentation.


Le poste concerne l’équipe de SeqOIA-GEN. Il est localisé sur le site de l’ancien hôpital Broussais, bâtiment Leriche à l’endroit où sont assurés l’accueil des échantillons, leurs préparations et le séquençage.

Des équipements de dernière génération ont été installés sur la plateforme, en particulier trois séquenceurs NovaSeq 6000®. Un quatrième séquenceur sera installé courant 2021.


Trois types d’analyses sont réalisés sur la plateforme : génome complet (WGS), exome complet (WES) et transcriptome (RNASeq) dans le domaine des maladies rares, du cancer puis des maladies communes.


L’équipe située sur Broussais est composée de 3 technicien.ne.s de laboratoire, d’un responsable qualité et de son adjointe, d’un directeur médical, d’un responsable administratif et d’une directrice opérationnelle. Cinq personnes de l’équipe d’une société chargée du séquençage travaillent également au sein du laboratoire. Ce recrutement vise à constituer une équipe de 4 technicien.ne.s de laboratoire.

 

Identification du poste

 

Établissement

GCS SeqOIA
Site Broussais - Bâtiment Leriche – RDC Bas
Rue Huguette Schwartz, 75014 PARIS

 

Définition générale du poste

Le.la technicien.ne de la plateforme SeqOIA-GEN assure la réalisation technique des examens médicaux sous la responsabilité du Biologiste Responsable.
Il assure l’ensemble des étapes techniques incluant réception des échantillons, extraction des acides nucléiques, préparation des librairies et séquençage haut débit. Ces missions se font en lien avec l’équipe de la société chargée du séquençage, dans un management de la qualité intégré.

 

Activités principales :

 

Activités pré-analytique :

  • Réception des prélèvements biologiques et enregistrement sur le logiciel de e-prescription
  • Contrôle de la conformité des demandes des examens (prescription, acheminement et échantillons)

Activités analytiques :

  • Réalisation des examens biologiques :
    o    Extraction des acides nucléiques (prélèvements sanguins et tissus congelés)
    o    Contrôle de la qualité des acides nucléiques
    o    Préparation des banques de séquençage (génome, exome, transcriptome)
    o    Identitovigilance
    o    Chargement et lancement du séquenceur haut débit (NovaSeq®, Illumina)
  • Mise en oeuvre des contrôles qualité internes et externes
  • Vérification analytique des résultats obtenus
  • Participation à la mise en place de nouvelles techniques analytiques et à leurs validations techniques
  • Stockage des échantillons

Participation au système qualité du LBM :

  • Participation active à la politique qualité instaurée par le LBM (IS15189)
  • Utilisation du logiciel qualité (Kalilab®)
  • Assure la traçabilité de ses activités
  • Participation à la déclaration et au traitement des non-conformités
  • Rédactions de la documentation inhérente à son activité

Divers :

  • Gestion des stocks de réactifs et consommables
  • Participation à la maintenance des automates
  • Utilisation du Système Informatisé du Laboratoire
  • Participe à la vie du laboratoire (tri et évacuation des déchets, rangement des paillasses et laboratoires etc.)

Positionnement du poste et compétences requises

Liens hiérarchiques

  • Le directeur médical du LBM SeqOIA
  • La directrice opérationnelle de la plateforme

Liens fonctionnels

  • Les prescripteurs et les biologistes
  • Les technicien.ne.s de laboratoire
  • Le responsable assurance qualité et son adjointe

Connaissances associées

  • Connaissance des techniques de biologie moléculaire de base (extraction des acides nucléiques, techniques PCR, identitovigilance etc.)
  • Connaissances informatiques de base (SGL, Kalilab etc.)
  • Connaissances des règles d’hygiène et de sécurité au travail

Qualités requises

  • Capacité à communiquer et s’adapter au travail en équipe
  • Connaissance de l’anglais technique
  • Sens de l’organisation et rigueur méthodologique
  • Sens des responsabilités et esprit d’initiative
  • Précision, rigueur dans l’organisation et l’exécution du travail
  • Capacité à discuter avec différents professionnels : cliniciens, biologistes, bio-informaticiens…
  • Capacités à suivre des instructions de travail
  • Conscience professionnelle
  • Disponibilité, autonomie
  • Respect du secret professionnel
  • Respect des règles de qualité et de sécurité (Norme ISO15189, risques professionnels etc.)
  • Capable de faire un retour synthétique du travail effectué et des difficultés rencontrées
  • Capacité à prendre des initiatives

Conditions de travail

Poste à 100%. Pas de télétravail possible.

 

Plages horaires du laboratoire : lundi au vendredi de 8H à 18H30.
Les horaires de présence sont fixes, en 7h par jour, à organiser entre 8h et 17H30 avec une pause déjeuner de 1h.

Participation à une astreinte du laboratoire rémunérée en supplément du salaire fixe, en moyenne une semaine tous les deux mois.

La rémunération proposée tiendra compte de l’ancienneté du/de la candidat.e.

Contact: 

Florence Baguet,
directrice opérationnelle du GCS SeqOIA
florence.baguet@laboratoire-seqoia.fr