Personne à contacter :

Lara Vinauger, directrice opérationnelle du GCS ; lara.vinauger@aphp.fr

Embauche en CDI par l’un des établissements du GCS et mise à disposition (MAD) du laboratoire SeqOIA.

Pour les personnels déjà employés par l’un des établissements du GCS : MAD du laboratoire SeqOIA.

Presentation du laboratoire SeqOIA

Le laboratoire SeqOIA (Sequencing, Omics, Information Analysis) est l’un des deux laboratoires de biologie médicale sélectionné par le Ministère des Solidarités et de la Santé dans le cadre du Plan France Médecine Génomique 2025.

Le support juridique du laboratoire est un Groupement de Coopération Sanitaire (GCS SeqOIA) de droit privé associant l’AP-HP, l’Institut Curie et Gustave Roussy, en lien avec la société industriel Integragen.

Le laboratoire SeqOIA comprends deux plateaux techniques non accessibles au public :

• SeqOIA-GEN (site Broussais): réception et enregistrement des prélèvements, extraction, quantification, qualification des acides nucléiques, préparation des librairies, séquençage;
• SeqOIA-IT (site Picpus): site depuis lequel sont opérés développement et maintenance des chaines de traitement bioinformatique, développement et maintenance des solutions logicielles (Sonar, SPICE, gGleaves), stockage-archivage des données et structuration des données, sur les serveurs hébergés par les centres de données de l’AP-HP

Les examens proposés par le laboratoire sont les suivants :

• Génétique constitutionnelle (maladies rares, oncogénétique): séquençage de génome (en trio dans plus de 80% des cas)
• Génétiques somatique (cancers) : analyse tumorale comprenant exome + génome + transcriptome tumoral et génome constitutionnel

Les prescriptions sont issues de la zone SeqOIA : régions Ile-de-France, Bretagne, Pays de la Loire, Normandie, Hauts de France, Centre Val de Loire.

Les pré-indications sont au nombre de 60 en maladies rares, 2 en oncogénétique et 8 en cancer.

Les examens sont interprétés et validés à distance par plus de 180 biologistes repartis dans la zone SeqOIA.

Offre de poste

L’offre de poste concerne l’équipe technique SeqOIA-GEN, sur le site Broussais : bâtiment Ady Steg, RDC bas, rue Huguette Schwartz, 75014 PARIS.

Le plateau technique est équipé de 4 séquenceurs NovaSeq6000. La préparation des librairies n’est pas automatisée. Une robotisation est prévue.

L’équipe technique est actuellement constituée de 4 techniciens de laboratoire et de 2 ingénieurs techniques.

Prérequis à la candidature :

• Diplôme de technicien de la laboratoire et enregistrement au fichier ADELI
• Expérience en séquençage haut-débit
• Qualité professionnelles : rigueur, capacité d’adaptation et esprit d’équipe

Fiche de poste

MISSIONS TECHNIQUES :

• extraction des acides nucléique
• contrôles qualité des acides nucléiques
• préparation des librairies (génome, exome, transcriptome)
• identitovigilance humide
• séquençage (multiplexage des librairies, chargement des supports de séquençage et lancement du séquençage)
• Monitorage des indicateurs bioinformatiques post-séquençage, investigation des écarts et dérives
• Participation aux optimisations ainsi qu’aux évolutions techniques
• Réception, stockage, destockage des réactifs, gestion des déchets
• Maintenance régulière des instruments

LIENS HIÉRARCHIQUES AU SEIN DU LABORATOIRE :

• Ingénieurs techniques : n+1
• Directeur du laboratoire (biologiste-responsable du laboratoire) : n+2

LIENS FONCTIONNELS  AU SEIN DU LABORATOIRE :

• Biologiste-responsable du laboratoire et biologistes de site
• Ingénieurs techniques
• Techniciens de laboratoire
• Chargées de parcours de génomique du laboratoire
• Qualiticiennes

LIENS ADMINISTRATIFS :

• Directrice opérationnelle du GCS 
• Adjointe à la directrice opérationnelle du GCS

Conditions de travail

Poste à 100%.

Pas de télétravail possible.

Plages horaires du laboratoire : lundi au vendredi de 8h à 18h30.

Les horaires de présence sont fixes :  7h30 par jour, à définir en fonction des besoins entre 8h et 17h30, avec une pause déjeuner de 30min sur le temps de travail.

Astreinte rémunérée en supplément du salaire fixe : une semaine tous les deux mois en moyenne.

La rémunération proposée tiendra compte de l’ancienneté du candidat.