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Plateforme de métabolomique
Unité mixte de service de rattachement
US23 – AMMICa
Responsable opérationnel
Claudia Grajeda-Iglesias
Responsable scientifique
Guido Kremer
Thématiques de recherche
Analyse spatiale, Bioinformatique / analyse de données, Métabolomique
Présentation
Les spectromètres de masse équipant la plateforme de métabolomique permettent la mesure de toutes les classes potentielles de métabolites, aussi bien pour des approches ciblées que non ciblées ; le profilage est réalisé au moyen d'un spectromètre de masse haute résolution (HRMS) couplé à une chromatographie ultra haute performance (UHPLC).
L'analyse métabolomique ciblée repose sur la technique MRM (multiple reaction monitoring) après séparation par UHPLC, en fonction des propriétés du métabolite d'intérêt. Sont quantifiés en routine acides aminés et dérivés, acides biliaires, acides gras, acylcarnitines, acylglycérides, nucléotides, lipides neutres, molécules de la glycolyse et du cycle de Krebs, entre autres.
Les analyses peuvent être effectuées sur divers types d'échantillons biologiques, tels que des biofluides, contenus fécaux, ou biopsies tissulaires issus de cohortes humaines, d'expérimentations animales ou de cellules en culture. La technologie d'imagerie par spectrométrie de masse permet d'analyser de manière non biaisée la distribution spatiale de milliers de métabolites au sein de tissus biologiques ou de cultures cellulaires.
La plateforme dispose des moyens techniques requis pour la réalisation d'un projet faisant appel à la métabolomique, depuis l'extraction des métabolites de la matrice biologique jusqu'à l'analyse des données et le rendu des résultats.
Nos services
Liste non exhaustive des prestations proposées :
- Définition et conception du dessin expérimental
- Conseils concernant la mise en place du projet
- Conseils et aide à la préparation de l'échantillon / contrôle qualité
- Analyse par profilage LCMS
- Analyses ciblées de familles de molécules : AnP / Coenzymes / Cofacteurs ; Polyamines ; Sucres phosphates / glycolyse ; Acides biliaires ; Acides gras à chaînes courtes ; Acides gras libres ; Carnitines, phosphatidylcholine…
- Analyses ciblées à façon
- Expérience de labelling isotopique
- Imagerie par spectrométrie de masse
- Mesure de masse à haute résolution
- Traitement des données
- Analyse bioinformatique et statistique
- UHPLC U3000 Dionex — Orbitrap q-Exactive Thermo Scientific
- UHPLC 1290 Binary Pump Agilent — QQQ 6470 Agilent
- UHPLC 1290 Binary Pump Agilent — QQQ 6475 Agilent
- NanoLC Vanquish Neo — Orbitrap Excedion pro Hybrid MS (disponible à partir d’octobre 2026)
- DESI XS – Synapt XS Waters
Nous contacter
Si vous envisagez de nous confier une analyse, contactez-nous pour en savoir plus sur les options disponibles, définir la prestation, et établir un devis : metabolomique@gustaveroussy.fr
Notre Equipe
GRAJEDA IGLESIAS Claudia - Responsable opérationnel plateforme
Ingénieur de recherche, Gustave Roussy
KROEMER Guido - Responsable scientifique plateforme
Chercheur fonctionnaire
APRAHAMIAN Fanny
Technicien de recherche, Gustave Roussy
DIAGNE Abdoulaye
Technicien de recherche, Gustave Roussy
Publications clés
Contact
- Adresse
-
Gustave Roussy
114, rue Édouard-Vaillant
94805 Villejuif Cedex - France
Pavillons de recherche - PR1 +3
- Téléphone
- 01.42.11.52.16
Responsable opérationnel de la plateforme
Claudia Grajeda-Iglesias - claudia.grajedaiglesias@gustaveroussy.fr