Biologie et Pathologie Médicales, des analyses essentielles au parcours de soins

Ici, tout commence par la réception centralisée des prélèvements : un service dédié, commun à l’ensemble du département, reçoit tous les échantillons de patients destinés à être analysés au sein du laboratoire de biologie médicale et d’anatomocytopathologie de Gustave Roussy. Baptisé Corebiopath, ce service assure l’accueil, la réception, le tri et l’enregistrement de chaque échantillon. 

Six services spécialisés structurés en deux grands pôles gravitent autour de Corebiopath.

Le Pôle Biologie rassemble l’ensemble des spécialités de biologie médicale et réalise les analyses biologiques courantes, ainsi que des tests spécialisés visant à identifier des marqueurs tumoraux ou d’éventuelles prédispositions génétiques. Le Pôle Pathologie a quant à lui pour activité principale l’identification et la caractérisation de lésions tumorales à partir de prélèvements cellulaires et tissulaires. Ces examens sont prescrits par les médecins de Gustave Roussy pour les patients de l’Institut, mais peuvent aussi être demandés par des praticiens extérieurs désireux de bénéficier de notre expertise.

À la découverte des différents services du Département de Biologie et Pathologie Médicales de Gustave Roussy.

Le service de Biochimie réalise des examens de biochimie générale, de biochimie spécialisée et d’hémostase. Il assure le dosage des marqueurs biologiques utiles à la détection et à la surveillance de certains cancers et le suivi des perturbations biologiques induites par les traitements anticancéreux. Une forte automatisation de cette activité permet de répondre aux besoins de Gustave Roussy, tant du point de vue du diagnostic et du suivi des patients que de la prise en charge de certains essais cliniques.

Le service d'Hémato-immunologie assure les analyses d'hématologie cellulaire et d'immunologie cellulaire. Il réalise le diagnostic cytologique, phénotypique et moléculaire des hémopathies lymphoïdes et myéloïdes. Il assure le suivi de la maladie résiduelle sous traitement et à long terme. Il participe à la prise en charge des patients traités par greffe de moelle osseuse et au suivi des patients recevant des thérapies cellulaires innovantes.

Le service de Microbiologie prend en charge le diagnostic des infections bactériennes, fongiques et virales ainsi que la surveillance des réactivations virales chez les patients allogreffés de moelle. Il participe au conseil en antibiothérapie auprès des cliniciens. Il réalise par ailleurs le contrôle microbiologique des secteurs protégés d’hospitalisation et des locaux de production de produits thérapeutiques. Son équipe collabore étroitement avec l’équipe opérationnelle d’hygiène pour la surveillance et la prévention des infections liées aux soins.

Le service de Pharmacologie réalise le dosage de médicaments anticancéreux dans le cadre d’un suivi thérapeutique (thérapies orales ciblées, hormonothérapies, anticorps monoclonaux) ou d’un monitoring avec modélisation pharmacocinétique (busulfan, fludarabine, melphalan, sels de platine). Ces analyses aident à l’adaptation des posologies des traitements afin d’optimiser leur efficacité et de limiter leurs toxicités. Le service réalise également le dosage de biomarqueurs métaboliques innovants (2HGA, succinate) ainsi que le dépistage des déficits en DPD par phénotypage. L’offre d’onco-pharmacologie évolue régulièrement, en lien avec les avancées thérapeutiques, afin de répondre au mieux aux nouveaux besoins cliniques.

Le service de Génétique des tumeurs réalise des analyses moléculaires dans trois grands domaines : la cytogénétique, la génétique somatique des tumeurs, la génétique constitutionnelle (oncogénétique) et le profilage génomique des biopsies liquides. Les examens réalisés contribuent au diagnostic, à l'évaluation pronostique et au choix de la stratégie thérapeutique dans le cadre des tumeurs solides. Ils participent également à l'identification des prédispositions au cancer, une information essentielle pour la prise en charge des patients et de leur famille. L'évolution rapide des technologies et des indications des analyses moléculaires nécessite une très grande réactivité du service pour répondre aux besoins des patients et des établissements externes avec lesquels nous avons une convention.

Le service de Pathologie a pour activité principale le diagnostic et la caractérisation des proliférations tumorales. Pour le découvrir en détail, c’est ici 

Le Département de Biologie et Pathologie Médicales dispense de nombreuses formations en interne et en externe, à destination d’un large public : médecins, biologistes et pathologistes, DES, étudiants en médecine et en pharmacie, techniciens, personnels paramédicaux… Les membres du Département participent régulièrement aux actions de formation organisées par les autres Départements. Plusieurs membres du Département ont des fonctions universitaires en Faculté de Médecine ou de Pharmacie.

Par ailleurs, les praticiens, biologistes et pathologistes contribuent activement aux activités de recherche menées au sein de Gustave Roussy, dans le cadre de leur domaine de spécialisation. Certains sont responsables de structures ou de plateformes de recherche. Plusieurs d’entre eux sont actifs dans les sociétés savantes de leur spécialité et participent à l’organisation de congrès nationaux et internationaux.

→ Découvrez les principales publications dont ils sont les auteurs

Le Pôle Biologie du département rassemble les spécialités de biologie médicale et réalise les analyses biologiques courantes et des tests spécialisés, prescrits par les médecins de Gustave Roussy mais aussi par des praticiens extérieurs. Désigné Laboratoire de Biologie Médicale de Référence (LBMR), conformément à l’arrêté du 18 janvier 2022 modifiant l’arrêté du 15 juillet 2021, il est ainsi un laboratoire de biologie médicale de recours reconnu au niveau national pour un/des examens de biologie médicale ou pour une/des pathologies déterminées dans 4 spécialités pour 14 examens de biologie médicale ou pour une/des pathologies déterminées. 

Le LBMR de Gustave Roussy place ainsi à la disposition d’acteurs extérieurs son environnement et ses compétences spécifiques en oncologie, garantissant un savoir-faire opérationnel qui permet d’accompagner des soins spécialisés et de conseiller, réaliser et interpréter des examens spécifiques nécessaires à la prise en charge du cancer.

Consultez la liste des examens et pathologies concernés :

« Notre département est composé de plusieurs espaces, allant du circuit des prélèvements jusqu’aux lames qui nous permettent de poser notre diagnostic. Au cœur du laboratoire se trouve le lieu où l’on reçoit les prélèvements, qui nous arrivent des services cliniques, radiologie ou blocs opératoires. La première étape s’effectue au poste de macroscopie : les prélèvements importants pour le diagnostic sont sélectionnés avant d’être fixés dans des blocs en paraffine, à partir desquels nous réalisons des coupes très fines que l’on étale sur des lames de verre pour les colorer et les regarder au microscope. Ces blocs sont ensuite archivés et peuvent être conservés durant des années. Les archives sont précieuses dans les projets d’intelligence artificielle : les pathologistes sélectionnent les lames qui seront numérisées à l’aide d’un scanner de lames, une sorte de microscope équipé d’une caméra, enfermé dans une machine ». 

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Le programme de biopsie liquide FRESH, porté par Gustave Roussy en partenariat avec Roche et Foundation Medicine, est ouvert à l’ensemble des patients du territoire français. Il vise à développer et à promouvoir la biopsie liquide, qui repose sur la collecte et l'analyse d'échantillons sanguins des patients pour détecter des biomarqueurs tumoraux, permettant ainsi un suivi moins invasif et plus précis. FRESH, en facilitant l’accès à la biopsie liquide et en proposant l’expertise pour l’analyse des résultats et l’orientation thérapeutique, contribue à accélérer son adoption dans la pratique clinique. 

« Nous proposons des biopsies liquides à tous les patients avec un cancer avancé chez qui nous pourrions trouver de l’ADN tumoral circulant, quel que soit le type de cancer. Les résultats de la biopsie liquide peuvent nous donner une liste de gènes dont certains, quand ils sont mutés, peuvent être ciblés avec des molécules déjà existantes ou avec de nouvelles molécules évaluées dans des essais thérapeutiques, notamment à Gustave Roussy », explique la Dr Kaissa Ouali, oncologue médicale.

La Dr Marie Morfouace, responsable scientifique du programme, précise : « FRESH est un programme unique en Europe. Tous les centres hospitaliers français qui souhaitent y participer peuvent tout simplement entrer leur demande sur notre portail de prescription et envoyer un tube de sang à Gustave Roussy. La constitution d'un réseau de centres nationaux fédérés est indispensable et c'est évidemment le but du programme ».

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1. Le laboratoire de profilage génomique du Département de Biologie et Pathologie médicales utilise un test (FoundationOne Liquid CDx) exclusivement disponible à Gustave Roussy au niveau national. Ce test est capable d’analyser un panel de plus de 300 gènes pour rechercher les altérations génomiques qui provoquent l’initiation ou le développement des cancers.
2. L’interprétation des résultats est basée sur une grande expertise tant pour l’analyse des mutations que pour une orientation thérapeutique.