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Criblage cellulaire à haut débit (CCHD)
Unité mixte de service de rattachement
US23 - RENNEVILLE
Plateforme
US23 - Criblage cellulaire à haut débit
Type de plateforme
Plateforme technologique
Responsable scientifique
Dr Oliver KEPP
Thématiques de recherche
Criblage haut débit, Imagerie cellulaire, Imagerie multiplexe, Microscopie, Cytométrie, Analyse spatiale
Résumé
La plateforme intègre des technologies avancées de biologie cellulaire automatisée et de criblage à haut contenu afin d'étudier les mécanismes moléculaires du stress cellulaire, de la mort cellulaire régulée et de la mort cellulaire immunogène. L'infrastructure combine manipulation robotisée des échantillons, microscopie automatisée, imagerie de fluorescence multiplexée et pipelines d'analyse computationnelle pour réaliser des approches de criblage phénotypique à haut débit. Une équipe dédiée d'ingénieurs et de scientifiques assure l'optimisation des workflows automatisés et des environnements d'analyse de données.
La plateforme permet la caractérisation systématique des réponses au stress cellulaire induites par des agents pharmacologiques, des perturbations génétiques ou des stimuli environnementaux, avec un intérêt particulier pour le stress du réticulum endoplasmique, le stress oxydatif, le dysfonctionnement mitochondrial et l'autophagie. L'imagerie sur cellules vivantes associée à des analyses multiparamétriques permet le suivi dynamique des réponses au stress et de l'exposition des signaux de danger.
La plateforme CCHD joue un rôle central dans l'étude de la mort cellulaire immunogène et dans l'identification d'inducteurs capables de stimuler l'immunité antitumorale. Des essais de co-culture et des analyses assistées par intelligence artificielle complètent ces approches pour des études mécanistiques et translationnelles en cancérologie.
Enfin, la plateforme fournit des pipelines computationnels évolutifs pour le traitement d'images, l'extraction de caractéristiques et l'analyse intégrative des données assistée par intelligence artificielle, permettant la génération de jeux de données multidimensionnels robustes et reproductibles pour la recherche translationnelle en cancérologie.
Nos services
Criblage phénotypique de chimiothèques sur lignées immortalisées/modifiées :
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Caractérisation des modalités de mort cellulaire (apoptose, nécroptose, ferroptose, mort cellulaire immunogène)
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Etude et modulation des mécanismes de stress cellulaire (autophagie, stress du réticulum endoplasmique)
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Etude de toxicité sur organoïdes (organoïdes synthétiques, PDX/O et lignées issues de PDX/O)
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Etude d’infiltration immunitaire d’organoïdes traite par des agents anticancer
Imagerie a haut-débit et haut-contenu
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Acquisition de plaques (format 96 ou 384-puits)
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Essais sur cellules fixées ou vivantes
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Acquisition jusqu’à 4 canaux de fluorescence et en lumière transmise
Notre plateforme de criblage cellulaire à haut-débit repose sur un ensemble d'équipements automatisés et parfaitement interconnectés, conçus pour garantir reproductibilité, rapidité et précision à chaque étape du processus expérimental.
Au cœur du dispositif, le bras robotisé Motoman (Beckman-Coulter) assure la liaison entre tous les postes de la plateforme : grâce à sa pince de haute précision et à ses déplacements programmables sur 3 axes et 3 angles, il transporte plaques, réservoirs et cônes d'un module à l'autre, en adaptant vitesse et trajectoire à chaque étape du protocole. L'automate de manipulation de liquides Biomek (Beckman-Coulter), équipé de ses têtes de pipetage AP96/AP384 et Span-8, réalise les ajouts et transferts de liquides ainsi que les dilutions en série sous atmosphère stérile, sur un deck de 18 emplacements pilotés par positionnement automatisé (ALP). La distribution rapide de réactifs, ainsi que l'ensemencement automatique des cellules, sont assurés par les deux MultiDrop (ThermoFisher), tandis que les lavages en série, indispensables dans les essais de biologie moléculaire, sont réalisés par le Washer 405LS (BioTek).
Le stockage et le conditionnement des plaques sont pris en charge par le Cytomat24 (ThermoFisher), qui assure un suivi rigoureux de chaque consommable, ainsi que par des enceintes thermo-régulées dédiées à la culture cellulaire (37 °C, 5 % CO₂) et à la conservation à 4 °C des réactifs. Les Delidding stations (Beckman-Coulter) complètent ce dispositif en assurant l'ouverture automatique des plaques, garantissant leur stérilité tout au long de l'expérimentation.
L'acquisition d'images repose sur cinq microscopes à épifluorescence ImageXpress® High-Content Imaging System (Molecular Devices) :
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deux systèmes widefield Micro XLS intégrés (souce lumineuse LED, caméra CMOS monochrome 16-bit, objectifs 10X/20X/40X PlanAPO, 5 jeux de filtres multibandes) ;
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un système widefield Micro XLS stand-alone (souce lumineuse LED, caméra CMOS monochrome 16-bit, objectifs 2X/10X/20X PlanAPO, 5 jeux de filtres multibandes, module de contrôle environnemental pour essais longue durée) ;
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un système Micro Confocal (souce lumineuse LED, caméra CMOS monochrome 16-bit, objectifs 2X/10X/20X/60X PlanAPO, objectif 20X contraste de phase, 5 jeux de filtres multibandes, module de contrôle environnemental pour essais longue durée, module d’acquisition en lumière transmise, double configuration spinning disk 60 µm/50 µm et mode widefield) ;
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un système HCS.ai Advanced (source lumineuse laser, caméra sCMOS monochrome 16-bit à champ très large, objectifs 4X/10X à air, 20X/40X à immersion dans l'eau, 8 canaux de fluorescence, module de contrôle environnemental pour essais longue durée, module d’acquisition en lumière transmise, double configuration spinning disk 60 µm/50 µm et mode widefield).
Enfin, le spectromètre Spectramax i3X (Molecular Devices) complète les modalités d'acquisition par mesure d'absorbance, de fluorescence et de luminescence sur plaques 96 et 384 puits.
L'intégration logicielle de l'ensemble via le système SAMI EX (Beckman-Coulter) permet d'enchaîner automatiquement pipetage, distribution, lavage, incubation et acquisition sans intervention manuelle, offrant une solution complète, fiable et évolutive pour les campagnes de criblage cellulaire à haut-débit.
La plateforme propose un service intégré de criblage phénotypique à haut débit et à haut contenu dédié à l'étude des réponses cellulaires et à l'identification de composés bioactifs : robotique de manipulation d'échantillons, microscopie automatisée, imagerie de fluorescence multiplexée, imagerie sur cellules vivantes, pipelines computationnels et outils d'analyse de données assistés par intelligence artificielle. Le service inclut le développement et l'optimisation de tests cellulaires, l'automatisation des workflows expérimentaux, la réalisation de campagnes de criblage, l'acquisition et l'analyse d'images ainsi qu'un accompagnement méthodologique et analytique pour des projets académiques et industriels en pharmacologie, toxicologie et recherche translationnelle.
Nous contacter
Si vous envisagez de nous confier une analyse, contactez-nous pour en savoir plus sur les options disponibles, définir la prestation, et établir un devis : oliver.kepp@gustaveroussy.fr
Equipe
DENG Xiaolian
Doctorant
DOFFE Flora
Post-Doctorant
KEPP Oliver - responsable opérationnel de plateforme
Directeur de recherche, Inserm
LEDUC Marion
Ingénieur d'études
SHEN Zhe
Doctorant
VALET Marie
Doctorant
XUE Enfu
Doctorant
ZHAO Liwei
Post-doctorant
LIU Peng
Chargé de recherche
JOIRE Camille
Ingénieur d'études
ALEGRE-CORTES Eva
Post-doctorant
FENG Chenxi
Doctorant
CHAI Ke
Doctorant
Publications clés
Contact
- Adresse
-
Pavillons de recherche
- Téléphone
- 4516
Responsable opérationnel de la plateforme
Oliver KEPP
oliver.kepp@gustaveroussy.fr