• Pré-analytiques

  • Inclusion d’échantillons en paraffine

  • Coupe de tissus congelés et fixés 

  • Réalisation de copeaux et de TMA (Tissue Micro Array)

  • Préparation de culot cellulaire, organoïde

• Analytiques

  • Immunohistohimie monomarquage chromogénique (BenchMark Ultra Plus)

  • Immunohistochimie multi-marquage chromogénique et fluorescente (Discovery Ultra, Bond RX, COMET)

  • Hybridation in situ / FISH (BenchMark Ultra Plus)

  • Transcriptomique et protéomique spatiales (Merscope, GeoMx, Visium, COMET, Xenium)

• Post-analytiques

  • Numérisation d’images haut débit polyvalent (lumière blanche, fluorescence, Olympus VS120, et VS200)

  • Scanner multispectral (Akoya Polaris)

  • Analyse d’images (Halo, QuPath)

• Pré-analytique : 7 microtomes, 1 cryostat NX70

• Analytique : 

  • Marquages IHC : 2 BenchMark Ultra Plus, 1 Discovery Ultra, 2 Bond RX, 

  • Colorations de routine ou spéciales : 1 automate Gemini AS et BSS, 

  • Biologie spatiale : 2 COMET, 1 Merscope, 1 GeoMx, 2 Visium CytAssist, 1 Xenium

• Post-Analytique : 3 scanners de lames VS120 et VS200, 1 scanner Polaris, 3 microscopes (2 têtes ; DM1000, DM5500 fluo pour FISH).

La plateforme PETRA de Gustave Roussy regroupe des expertises allant du pré-analytique au post-analytique pour l'étude d'échantillons humains et animaux. En amont, elle assure l'inclusion en paraffine, la coupe de tissus congelés ou fixés, la réalisation de TMA et la préparation de culots cellulaires ou d'organoïdes. La phase analytique comprend l'immunohistochimie en mono ou multi-marquage (chromogénique ou fluorescent), l'hybridation in situ / FISH et le profilage spatial en transcriptomique et protéomique. En aval, la plateforme propose la numérisation d'images à haut débit via différents scanners et leur analyse grâce à des logiciels spécialisés.

PETRA propose avant tout un accompagnement expert pour concevoir et sécuriser les projets expérimentaux en histologie et biologie spatiale : conseil dans le choix des techniques (analyses protéiques ou transcriptomiques), optimisation de la mise en place des expériences (sélection et préparation des échantillons, définition des panels), validation des marquages (anticorps, sondes) et des protocoles. En fonction des besoins, elle oriente vers les approches les plus pertinentes (immunohistochimie, FISH, RNAscope, Merscope, Visium, Xenium, GeoMx).