Laboratoire d’immunomonitoring en oncologie (L.I.O)

Activités

Le laboratoire d’Immunomonitoring en oncologie (LIO), créé fin 2014, est une unité de recherche translationnelle. Le principal objectif du laboratoire est d’identifier des biomarqueurs sanguins ou tumoraux pouvant prédire la réponse ou la résistance aux immunothérapies anti-tumorales, ainsi que l’émergence de certains effets indésirables immunologiques pouvant être liés à ces traitements. Un autre objectif est de comprendre les mécanismes d’action des immunothérapies anti-tumorales.

Le LIO est spécialisé dans l’évaluation des profils immunologiques et dans l’analyse fonctionnelle des sous-populations immunitaires en temps réel sur échantillons frais. Il assure le suivi et la caractérisation des réponses immunitaires consécutives à l'administration de produits thérapeutiques immunomodulateurs (anticorps bloquant les check-points immunitaires, anticorps monoclonaux agonistes, cytokines…) chez des patients atteints d’un cancer.

En collaboration avec des industriels, le LIO est impliqué dans l’évaluation préclinique de certaines immunothérapies afin d’en comprendre le mécanisme d’action, mais aussi de prédire les combinaisons thérapeutiques les plus efficaces pour traiter les patients.

Compétences et expertises

Le LIO a développé et validé une cytométrie 10 couleurs standardisée à l’aide de panels lyophilisés (DuraClone®, Beckman Coulter), permettant de suivre quantitativement et qualitativement la plupart des populations du système immunitaire dans le cadre d’essais cliniques sur sang total ou biopsies de tissus frais.

Le LIO réalise des tests fonctionnels de re-stimulation ex-vivo des PBMC ou des lymphocytes infiltrant les tumeurs.

Le LIO a développé une expertise dans l’analyse d’immunothérapies innovantes dans des modèles précliniques murins dans le cadre de contrats scientifiques avec des industrielles.

Le LIO développe en parallèle ses propres projets de recherche afin de mieux comprendre fonctionnellement l’implication de certaines populations immunitaires dans l’efficacité ou la résistance aux immunothérapies anti-tumorales.

 Prestations proposées

• Caractérisation phénotypique de différentes populations immunitaires dans le sang, les PBMC et les tissus tumoraux
• Caractérisation fonctionnelle de différentes populations immunitaires
• Quantification multiplexe de facteurs solubles dans le plasma, sérum et surnageants de culture
• Analyses des données de cytométrie en flux
• Interprétation à façon des données expérimentales selon les demandes des collaborateurs académiques ou industriels
• Développement de nouveaux panels de cytométrie (jusqu’à 13 couleurs) et de tests fonctionnels en collaboration avec les porteurs de projet
• Conseil en immunologie antitumorale
• Conseil en développement de projets de recherche portant sur l’immunothérapie anti-tumorale

Equipements

• 1 MACSQuant 16 Cytometer – Miltenyi Biotec Inc.
• 1 CytoFLEX S base Cytometer – Beckman Coulter
• 2 GALLIOS Cytometer – Beckman Coulter
• MAGPIX Multiplexing System – Luminex B.V.
• MESO QuickPlex SQ 120 – Meso Scale Discovery (LRTI)
• GentleMACS Dissociator - Miltenyi Biotec Inc.
• Vi-CELL XR Cell Analyzer – Beckman Coulter
• xCELLigence RTCA - Agilent

Equipe

Responsable scientifique
Pr Nathalie Chaput-Gras
E-mail

Responsable opérationnel
Dr Lydie Cassard

Assistante Hospitalo-Universitaire
Dr Marie Naigeon

Ingénieur
Jean Jouniaux

Ingénieur d’étude
Lisa Boselli

Technicien
Jonathan Grivel
 

Principales publications

• Loriot Y, Marabelle A, Guégan JP, Danlos FX, Besse B, Chaput N, Massard C, Planchard D, Robert C, Even C, Khettab M, Tselika L, Friboulet L, André F, Nafia I, Le Loarer F, Soria JC, Bessede A, Italiano A. Plasma proteomics identifies Leukemia Inhibitory Factor (LIF) as a novel predictive biomarker of immune-checkpoint blockade resistance. Ann Oncol. 2021 Aug 17:S0923-7534(21)03978-8. doi: 10.1016/j.annonc.2021.08.1748. Epub ahead of print. PMID: 34416362.
• Terry S, Dalban C, Rioux Leclercq N, Adam J, Meylan M, Buart S, Bougoüin A, Lespagnol A, Dugay F, Colina Moreno I, Lacroix G, Lorens JB, Gausdal G, Fridman WH, Mami-Chouaib F, Chaput N, Beuselinck B, Chabaud S, Barros Monteiro J, Vano Y, Escudier B, Sautes-Fridman C, Albiges L, Chouaib S. Association of AXL and PD-L1 expression with clinical outcomes in patients with advanced renal cell carcinoma treated with PD-1 blockade. Clin Cancer Res. 2021 Aug 18:clincanres.0972.2021. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-21-0972. Epub ahead of print. PMID: 34407968.
• Pham F, Moinard-Butot F, Coutzac C, Chaput N. Cancer and immunotherapy: a role for microbiota composition. Eur J Cancer. 2021 Sep;155:145-154. doi: 10.1016/j.ejca.2021.06.051. Epub 2021 Aug 7. PMID: 34375896.
• Duchemann B, Remon J, Naigeon M, Cassard L, Jouniaux JM, Boselli L, Grivel J, Auclin E, Desnoyer A, Besse B, Chaput N. Current and future biomarkers for outcomes with immunotherapy in non-small cell lung cancer. Transl Lung Cancer Res. 2021 Jun;10(6):2937-2954. doi: 10.21037/tlcr-20-839. PMID: 34295689; PMCID: PMC8264336.
• Mezquita L, Preeshagul I, Auclin E, Saravia D, Hendriks L, Rizvi H, Park W, Nadal E, Martin-Romano P, Ruffinelli JC, Ponce S, Audigier-Valette C, Carnio S, Blanc-Durand F, Bironzo P, Tabbò F, Reale ML, Novello S, Hellmann MD, Sawan P, Girshman J, Plodkowski AJ, Zalcman G, Majem M, Charrier M, Naigeon M, Rossoni C, Mariniello A, Paz-Ares L, Dingemans AM, Planchard D, Cozic N, Cassard L, Lopes G, Chaput N, Arbour K, Besse B. Predicting immunotherapy outcomes under therapy in patients with advanced NSCLC using dNLR and its early dynamics. Eur J Cancer. 2021 Jul;151:211-220. doi: 10.1016/j.ejca.2021.03.011. Epub 2021 May 19. PMID: 34022698.
• Duchemann B, Remon J, Naigeon M, Mezquita L, Ferrara R, Cassard L, Jouniaux JM, Boselli L, Grivel J, Auclin E, Desnoyer A, Besse B, Chaput N. Integrating Circulating Biomarkers in the Immune Checkpoint Inhibitor Treatment in Lung Cancer. Cancers (Basel). 2020 Dec 3;12(12):3625. doi: 10.3390/cancers12123625. PMID: 33287347; PMCID: PMC7761725.
• Rivière E, Pascaud J, Virone A, Dupré A, Ly B, Paoletti A, Seror R, Tchitchek N, Mingueneau M, Smith N, Duffy D, Cassard L, Chaput N, Pengam S, Gauttier V, Poirier N, Mariette X, Nocturne G. Interleukin-7/Interferon Axis Drives T Cell and Salivary Gland Epithelial Cell Interactions in Sjögren's Syndrome. Arthritis Rheumatol. 2021 Apr;73(4):631-640. doi: 10.1002/art.41558. Epub 2021 Feb 15. PMID: 33058491.
• De Giglio A, Mezquita L, Auclin E, Blanc-Durand F, Riudavets M, Caramella C, Martinez G, Benitez JC, Martín-Romano P, El-Amarti L, Hendriks L, Ferrara R, Naltet C, Lavaud P, Gazzah A, Adam J, Planchard D, Chaput N, Besse B. Impact of Intercurrent Introduction of Steroids on Clinical Outcomes in Advanced Non-Small-Cell Lung Cancer (NSCLC) Patients under Immune-Checkpoint Inhibitors (ICI). Cancers (Basel). 2020 Sep 30;12(10):2827. doi: 10.3390/cancers12102827. PMID: 33007977; PMCID: PMC7599488.
• Ferrara R, Naigeon M, Auclin E, Duchemann B, Cassard L, Jouniaux JM, Boselli L, Grivel J, Desnoyer A, Mezquita L, Texier M, Caramella C, Hendriks L, Planchard D, Remon J, Sangaletti S, Proto C, Garassino MC, Soria JC, Marabelle A, Voisin AL, Farhane S, Besse B, Chaput N. Circulating T-cell Immunosenescence in Patients with Advanced Non-small Cell Lung Cancer Treated with Single-agent PD-1/PD-L1 Inhibitors or Platinum-based Chemotherapy. Clin Cancer Res. 2021 Jan 15;27(2):492-503. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-20-1420. Epub 2020 Sep 4. PMID: 32887723.
• Delahousse J, Skarbek C, Desbois M, Perfettini JL, Chaput N, Paci A. Oxazaphosphorines combined with immune checkpoint blockers: dose-dependent tuning between immune and cytotoxic effects. J Immunother Cancer. 2020 Aug;8(2):e000916. doi: 10.1136/jitc-2020-000916. PMID: 32784216; PMCID: PMC7418776.
• Desbois M, Béal C, Charrier M, Besse B, Meurice G, Cagnard N, Jacques Y, Béchard D, Cassard L, Chaput N. IL-15 superagonist RLI has potent immunostimulatory properties on NK cells: implications for antimetastatic treatment. J Immunother Cancer. 2020 Jun;8(1):e000632. doi: 10.1136/jitc-2020-000632. PMID: 32532840; PMCID: PMC7295443.
• Coutzac C, Jouniaux JM, Paci A, Schmidt J, Mallardo D, Seck A, Asvatourian V, Cassard L, Saulnier P, Lacroix L, Woerther PL, Vozy A, Naigeon M, Nebot-Bral L, Desbois M, Simeone E, Mateus C, Boselli L, Grivel J, Soularue E, Lepage P, Carbonnel F, Ascierto PA, Robert C, Chaput N. Systemic short chain fatty acids limit antitumor effect of CTLA-4 blockade in hosts with cancer. Nat Commun. 2020 May 1;11(1):2168. doi: 10.1038/s41467-020-16079-x. PMID: 32358520; PMCID: PMC7195489.
• Michot JM, Albiges L, Chaput N, Saada V, Pommeret F, Griscelli F, Balleyguier C, Besse B, Marabelle A, Netzer F, Merad M, Robert C, Barlesi F, Gachot B, Stoclin A. Tocilizumab, an anti-IL-6 receptor antibody, to treat COVID-19-related respiratory failure: a case report. Ann Oncol. 2020 Jul;31(7):961-964. doi: 10.1016/j.annonc.2020.03.300. Epub 2020 Apr 2. PMID: 32247642; PMCID: PMC7136869.
• Mir O, Broutin S, Desnoyer A, Delahousse J, Chaput N, Paci A. Pharmacokinetics/Pharmacodynamic (PK/PD) relationship of therapeutic monoclonal antibodies used in oncology: what's new? Eur J Cancer. 2020 Mar;128:103-106. doi: 10.1016/j.ejca.2020.01.004. Epub 2020 Feb 20. PMID: 32089494.