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Pathologie Expérimentale et TRAnslationnelle
Unité mixte de service de rattachement
US23 – AMMICa
Type de plateforme
Plateforme technologique
Responsable scientifique
Pr Cécile Badoual
Thématiques de recherche
Analyse spatiale, Imagerie cellulaire, Imagerie multiplexe, Microscopie, Multi-omics, Modèles, Protéomique, Single-Cell, Transcriptomique
Résumé
La plateforme de Pathologie Expérimentale et TRAnslationnelle (PETRA) dirigée par la Pre Cécile Badoual a pour mission la réalisation de l’ensemble des techniques d’analyse morphologique et moléculaire in-situ, principalement en lien avec les essais cliniques et les protocoles de médecine de précision portés par Gustave Roussy mais aussi avec de nombreux programmes de recherche multicentriques nationaux ou internationaux. C'est une des plateformes d’appui et d’accompagnement à la recherche au sein de l’unité AMMICa (Analyse Moléculaire, Modélisation et Imagerie de la maladie Cancéreuse) créée en janvier 2015.
Elle dispose d’un équipement très complet lui permettant de réaliser l’ensemble des techniques d’histologie conventionnelle, d’immunohistochimie multiplexe et d’analyse d’images, et bénéficie de l’expertise des anatomo-pathologistes de Gustave Roussy. Elle propose des techniques de protéomique ainsi que de transcriptomique spatiales, grâce au soutien du Paris Saclay Cancer Cluster (PSCC), et a permis de renforcer, de valoriser ou de mettre en place des partenariats ou des collaborations académiques ou industrielles.
La plateforme propose la prise en charge des projets en intégrant un accompagnement personnalisé tout le long de la mise en place et de la réalisation des projets. PETRA prend en charge toutes les analyses morphologiques appliquées à des échantillons tissulaires ou cellulaires, humains et modèles animaux (PDX et organoïdes/ tumoroïdes) de l'étape pré-analytique aux analyses, ainsi que la numérisation des lames et leur interprétation.
PETRA apporte des expertises scientifiques, techniques et réglementaires, en lien avec une équipe multidisciplinaire.
La plateforme est membre du réseau des plateformes d’histologie d’iDF (Rés’Hist) et a obtenu le label des plateformes IBiSA. La plateforme est certifiée ISO 9001 depuis 2016.
Certification de la norme ISO 9001:2015
Nos services
La plateforme PETRA de Gustave Roussy regroupe des expertises allant du pré-analytique au post-analytique pour l’étude d’échantillons humains et animaux. En amont, elle assure l’inclusion en paraffine, la coupe de tissus congelés ou fixés, la réalisation de TMA et la préparation de culots cellulaires ou d’organoïdes. La phase analytique comprend l’immunohistochimie en mono ou multi-marquage (chromogénique ou fluorescent), l’hybridation in situ/FISH et le profilage spatial en transcriptomique et protéomique. En aval, la plateforme propose la numérisation d’images à haut débit via différents scanners et leur analyse grâce à des logiciels spécialisés. L’ensemble constitue une chaîne intégrée permettant une caractérisation fine des tissus et biomarqueurs, au service de la recherche et du diagnostic en oncologie.
La plateforme PETRA de Gustave Roussy propose avant tout un accompagnement expert pour concevoir et sécuriser les projets expérimentaux en histologie et biologie spatiale. Elle conseille les équipes dans le choix des techniques les plus adaptées aux objectifs scientifiques, qu’il s’agisse d’analyses protéiques ou transcriptomiques. PETRA intervient en amont pour optimiser la mise en place des expériences, depuis la sélection et la préparation des échantillons jusqu’à la définition des panels. Elle assure également la validation des marquages (anticorps, sondes) et des protocoles afin de garantir la robustesse et la reproductibilité des résultats. En fonction des besoins, elle oriente vers les approches les plus pertinentes (immunohistochimie, FISH, RNAscope, Merscope, Visium, GeoMx). Cette expertise permet d’optimiser la qualité des données et la réussite des projets.
Nous contacter
Si vous envisagez de nous confier une analyse, contactez-nous pour en savoir plus sur les options disponibles, définir la prestation, et établir un devis : contact-petra@gustaveroussy.fr
Si vous souhaitez nous soumettre une demande assez avancée, vous pouvez utiliser ce formulaire de prise de contact : https://forms.cloud.microsoft/e/3KLifURqKu?origin=lprLink
Après analyse de votre projet, une réponse vous sera apportée dans un délai maximum de 10 jours et une date de présentation vous sera proposée. PETRA se charge de vous mettre en relation avec la plateforme de génomique et de data si le projet le requiert
Equipe
BADOUAL Cecile - Responsable scientifique plateforme
Professeurs des universités-Praticiens hospitaliers
Employeur : Gustave Roussy
BANI Mohamed-Amine - Responsable scientifique plateforme
Praticien hospitalier
Responsable Adjoint de plateforme
Employeur : Gustave Roussy
BAWA Olivia
Ingénieur d'études ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
BORDELET Laeticia
Technicien de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
CAMARA CLAYETTE Valérie
Ingénieur de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
CAMUS Lily
Technicien de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
CHANSAVOIR Betty
Technicien de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
CHERON Maria Laura
Technicien de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
DUTERTRE Charles Antoine
Chercheur fonctionnaire
Employeur : Inserm
EDMOND Elodie
Technicien de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
GODEFROY Karine
Technicien de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
MARTY Virginie
Ingénieur d'études ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
RATHASKRISHNAN Adsaya
Technicien de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
ROLLAND Mailys
Technicien de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
SIGNOLLE Nicolas
Ingénieur de recherche ou assimilé
Employeur : Gustave Roussy
ZEARAMANE Anjeli
Autre statut dont apprenti
Employeur : Gustave Roussy
Publications clés
Contact
- Adresse
-
B2M
114, rue Edouard-Vaillant
94 805 Villejuif Cedex - France
Responsable opérationnel de la plateforme
Cécile Badoual
cecile.badoual@gustaveroussy.fr
