Dynamique et stabilité du génome

L'équipe « Dynamique et stabilité du génome » a pour objectif de comprendre comment les altérations du métabolisme et de la stabilité du génome influencent la tumorigenèse, la progression du cancer, le choix des traitements et le vieillissement.

Les projets de l’équipe font appel à un large éventail d’approches expérimentales, notamment des modèles cellulaires dérivés de souris et de patients, le séquençage du génome entier à l’aide de technologies de lecture courte et longue, des analyses génomiques fonctionnelles (par exemple, criblages CRISPR, ChIP-seq, END-seq, RNA-seq) et l’analyse de mégadonnées.

• Projet 1 – Mécanismes de formation et de ciblage des triplex d’ADN dans le cancer. Nos recherches ont montré que les cellules cancéreuses présentent des niveaux élevés de triplex d’ADN (H-ADN) — des structures d’ADN alternatives formées au cours de la réplication qui favorisent l’instabilité génomique. Notre groupe a pour objectifs : de comprendre les mécanismes à l’origine de la formation des triplex d’ADN dans les cellules cancéreuses ; d’identifier les types de tumeurs et les contextes biologiques dans lesquels les triplex d’ADN peuvent être ciblés à des fins thérapeutiques ; et d’utiliser ou de développer des petites molécules qui se lient aux triplex d’ADN et les stabilisent afin d’éliminer sélectivement les cellules cancéreuses. 

• Projet 2 – Cancers MSI : instabilité des répétitions et nouvelles interventions thérapeutiques. Notre objectif est d’identifier d’autres vulnérabilités dans les tumeurs MSI afin de mettre au point des stratégies thérapeutiques susceptibles de rendre les tumeurs dMMR/MSI entièrement traitables. Au sein de notre laboratoire, nous nous fixons les objectifs suivants : développer des protocoles de séquençage pour caractériser l’instabilité des répétitions dans les tumeurs dMMR/MSI ; élucider les mécanismes sous-jacents à l’instabilité des répétitions dans les tumeurs MSI ; et développer des fondements théoriques et des outils diagnostiques permettant de mieux identifier les patients susceptibles de bénéficier de nouvelles thérapies

• Projet 3 – Le choix de la voie de réparation des cassures double brin et son rôle dans la tumorigenèse. Nos recherches abordent les questions suivantes : quels mécanismes régissent le choix de la voie de réparation des cassures double brin (DSB) ? Une déficience en réparation homologie (HR) conduit-elle intrinsèquement à la tumorigenèse, ou y contribue-t-elle en favorisant des mécanismes de réparation alternatifs, sujets à des erreurs ? Comment l’inflammation et le vieillissement sont-ils liés à une réparation défectueuse de l’ADN médiée par la HR ?