Activités de la plateforme de bioinformatique
- Analyse de données de séquençage en (épi)génomique/transcriptomique (WGS/WES/TGS, RNA-seq, ChIP/ATAC-seq, Single-Cell, Long Reads)
- Gestion des données (récupération, centralisation, organisation, étiquetage, mise à disposition/partage)
- Support aux bioinformaticiens, biologistes, et cliniciens de Gustave Roussy
- Aide à la publication (matériel et méthodes, figures, dépôt des données sur les bases de données publiques comme GEO/SRA/EGA/dbGAP)
- Co-supervision de bioinformaticiens juniors (stagiaires, CDD, doctorants)
- Diffusion des savoirs et des compétences pour tous publics (formations internes, formations nationales, cours ouverts en ligne)
Equipements
- Cluster de calcul (1500 CPUs, 9 GPUs, 5To RAM, 2Po de stockage)
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